陽離子聚丙烯酰胺用途與陰離子聚丙烯酰胺相比，沒有那么的廣泛，主要是作為污水處理絮凝劑用于工業廢水或生活污水的處理。*典型的應用就是作為污泥脫水絮凝劑用途，處理有機廢水。陽離子聚丙烯酰胺俱備聚丙烯酰胺產品特性：比如絮凝性、減阻性、增稠性、粘合性等，因此可以作為絮凝劑、減阻劑、增稠劑、粘合劑等用途。陽離子聚丙烯酰胺還可以作為助留劑、助濾劑、紙張干濕強度增強劑等用途。
近年來，隨著人們對聚丙烯酰胺產品的了解，陰離子聚丙烯酰胺在各個工業廢水處理中的應用也越來越廣。一般，陰離子聚丙烯酰胺產品對于懸浮顆粒濃度高、粒子帶陽電荷，水的PH值為中性或堿性的污水，鋼鐵廠廢水，電鍍廠廢水，冶金廢水，洗煤廢水等污水處理，效果*。投加量是無機絮凝劑的1/50，但效果是無機絮凝劑的幾倍。
陰離子聚丙烯酰胺在淀粉廠及酒精廠的流失淀粉酒糟的回收中的應用：現在很多淀粉廠的廢水內含淀粉很多，現投加陰離子聚丙烯酰胺，使淀粉微粒絮凝沉淀，然后將沉淀物經壓濾機壓濾變成餅狀，可作飼料，酒精廠的酒精也可采用陰離子聚丙烯酰胺脫水，壓濾進行回收。
